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Manolis Kellis

Manolis Kellis是希臘出生的美國計算生物學家,MIT計算機科學教授、Broad Institute成員和MIT計算生物學組負責人,以比較基因組學、表觀基因組路線圖和人類疾病調控迴路研究著稱。

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詞條資料

生於雅典

Kellis生於1977年3月。⁠[1]

他自述生於希臘雅典,是John與Anna Kamvysselis最小的孩子,上有姐姐Maria和哥哥Panayiotis。⁠[2]

隨家人移居法國

12歲時父親為讓子女學會雙語,舉家遷往法國Aix-en-Provence;約四年後全家移居紐約,他在Lycée Français de New York取得Baccalauréat文憑。⁠[2]

獲法國南部數學競賽一等獎

1993年,他在法國全國性數學競賽中獲南法賽區一等獎。⁠[1]

獲MIT學士和工程碩士學位

他與哥哥、姐姐同年被MIT錄取。⁠[2]

轉向計算生物學之前,他曾在MIT和Xerox PARC從事人工智能、草圖與圖像識別、機器人和計算幾何研究。⁠[3]

他於1999年獲MIT學士和工程碩士學位。研究生一年級時,他看到朋友展示的人類基因組序列數據,隨即決定用計算方法解讀基因組。⁠[4]

在Nature發表酵母比較基因組論文

2003年5月15日,他作為第一作者在Nature第423捲髮表“Sequencing and comparison of yeast species to identify genes and regulatory elements”(通過測序與比較酵母物種識別基因和調控元件)。⁠[5]

獲MIT博士學位

2003年,他以論文Computational Comparative Genomics: Genes, Regulation, Evolution獲MIT博士學位;2003年6月至2004年6月在Broad Institute做博士後。他獲MIT計算機科學最佳博士論文Sprowls獎。⁠[1]

加入MIT教員隊伍

2004年,他成為MIT電氣工程與計算機科學系教員、計算機科學與人工智能實驗室(CSAIL)和Broad Institute成員,2011年獲終身教職,並領導MIT計算生物學組。⁠[4]

入選Technology Review TR35

2006年9月,29歲的他入選Technology Review評選的35歲以下創新者(TR35),獲選理由是開發分析多物種完整基因組的算法;當時他已把在酵母上驗證的方法用於比較人與小鼠、大鼠和狗的基因組。⁠[6]

任Class of 1964傑出校友職業發展講席

當時他是MIT電氣工程與計算機科學系助理教授,並擔任Class of 1964傑出校友職業發展講席。⁠[7]

獲總統早期職業科學家與工程師獎

2010年11月,MIT宣佈他由美國國立衛生研究院(NIH)提名,獲美國總統早期職業科學家與工程師獎(PECASE)。⁠[8]

參與29種哺乳動物比較基因組研究

2011年10月,Broad Institute牽頭、他參與的國際團隊在Nature發表29種哺乳動物基因組比較研究,繪製出超過350萬個約佔人類基因組4%的受約束元件,並鑑定出3788個候選新外顯子。⁠[9]

主導人類表觀基因組參考圖譜分析

2015年2月18日,他領導的團隊代表Roadmap Epigenomics項目在Nature發表111個人類參考表觀基因組,用機器學習劃分出15種染色質狀態,並把約200萬個預測調控區歸為200個協同作用模塊。⁠[10]

揭示FTO肥胖關聯的代謝開關

2015年8月19日,他作為通訊作者與第一作者Melina Claussnitzer在New England Journal of Medicine發表研究,發現與肥胖關聯最強的FTO區域主要在脂肪前體細胞中通過IRX3和IRX5調控脂肪儲存與產熱;以CRISPR/Cas9編輯單個鹼基即可在人類前脂肪細胞中切換胖與瘦的特徵。⁠[11]

在ECCB 2018作主題報告

2018年9月8日至12日在雅典舉行的第17屆歐洲計算生物學會議(ECCB 2018)將他列為主題報告人。⁠[12]

發表阿爾茨海默病單細胞圖譜

2019年5月1日,他與MIT Picower研究所所長Li-Huei Tsai作為共同通訊作者在Nature發表首個阿爾茨海默病患者單個腦細胞基因表達的全面分析,發現軸突髓鞘化顯著受損,且男女腦細胞對疾病的基因反應差異明顯。⁠[13]

首次做客Lex Fridman Podcast

第二次做客Lex Fridman Podcast

2020年9月12日,他第二次做客該節目(第123期),談表觀基因組、尼安德特人、地球生命起源、人類思想的演變,並朗誦了兩首詩。⁠[15]

第三次做客Lex Fridman Podcast

2020年10月25日,他第三次做客該節目(第133期),主題為人類疾病的生物學,涉及疾病的遺傳成分、基因組迴路、CRISPR和線粒體。⁠[16]

第四次做客Lex Fridman Podcast

2020年11月30日,他第四次做客該節目(第142期),談音樂與人生、人生意義、人類文明、神經網絡與智能以及作為生物體的思想,節目還列出他提到的希臘歌曲。⁠[17]

完成SARS-CoV-2基因註釋

2021年5月11日,他作為通訊作者與Irwin Jungreis、Rachel Sealfon在Nature Communications發表研究,比較44個沙貝病毒基因組,給出SARS-CoV-2迄今最完整的蛋白編碼基因註釋,並發現核衣殼蛋白某區域的突變明顯多於歷史預期。⁠[18]

第五次做客Lex Fridman Podcast

2023年4月21日,他第五次做客該節目(第373期),主題為人類文明的演化與超級人工智能,涉及AI對齊、AI對就業市場的影響、人與AI的關係、AI權利與監管以及是否應暫停AI開發。⁠[19]

在AIxMHC 2025線上演講

2025年10月14日,他在臺灣亞洲大學主辦的2025人工智能×醫療健康照護國際會議(AIxMHC 2025)上以線上方式演講,題為“Applications of Artificial Intelligence in Genomic Medicine”(人工智能在基因組醫學中的應用)。⁠[20]

截至2026年10月:MIT計算生物學組負責人

他是MIT計算機科學教授、CSAIL和Broad Institute成員,領導MIT計算生物學組,研究涵蓋計算生物學、基因組學、AI驅動的藥物發現以及知識探索平臺Mantis,已發表逾325篇期刊論文。他認為通用人工智能已經實現,並主張不宜對AI技術設置過多限制。⁠[21]

他曾領導或參與ENCODE、GTEx等大型基因組計劃,獲獎包括Mendel Medal、NIH院長變革性研究獎和AIT Niki獎。⁠[22]

關聯機構、網站與公開賬號

Massachusetts Institute of Technology:官網:https://www.mit.edu/(在新窗口打開)⁠[7]

來源

  1. Professional Statement of Manolis Kellis(在新窗口打開)
  2. Manolis Kamvysselis: Me Myself and I(在新窗口打開)
  3. Manolis Kellis - Biosketch(在新窗口打開)
  4. Getting to the root of genetics | MIT News | Massachusetts Institute of Technology(在新窗口打開)
  5. Sequencing and comparison of yeast species to identify genes and regulatory elements - PubMed(在新窗口打開)
  6. Manolis Kellis | MIT Technology Review(在新窗口打開)
  7. MIT faculty, alumni cited as top young innovators in Technology Review | MIT News | Massachusetts Institute of Technology(在新窗口打開)
  8. 7 win presidential early career honors | MIT News | Massachusetts Institute of Technology(在新窗口打開)
  9. Understanding the constraints of evolution provides roadmap to mammalian biology | ScienceDaily(在新窗口打開)
  10. Researchers generate a reference map of the human epigenome | MIT News | Massachusetts Institute of Technology(在新窗口打開)
  11. A metabolic master switch underlying human obesity | MIT News | Massachusetts Institute of Technology(在新窗口打開)
  12. Keynote Speakers - ECCB 2018(在新窗口打開)
  13. A comprehensive map of how Alzheimer's affects the brain | ScienceDaily(在新窗口打開)
  14. #113 - Manolis Kellis: Human Genome and Evolutionary Dynamics | Lex Fridman Podcast(在新窗口打開)
  15. #123 - Manolis Kellis: Origin of Life, Humans, Ideas, Suffering, and Happiness | Lex Fridman Podcast(在新窗口打開)
  16. #133 - Manolis Kellis: Biology of Disease | Lex Fridman Podcast(在新窗口打開)
  17. #142 - Manolis Kellis: Meaning of Life, the Universe, and Everything | Lex Fridman Podcast(在新窗口打開)
  18. A comprehensive map of the SARS-CoV-2 genome | ScienceDaily(在新窗口打開)
  19. #373 – Manolis Kellis: Evolution of Human Civilization and Superintelligent AI | Lex Fridman Podcast(在新窗口打開)
  20. Day 2 of Asia University’s “AIxMHC” International Conference | Ph.D. Program in Artificial Intelligence(在新窗口打開)
  21. The Revolutionary Potential of AI with CSAIL Professor Manolis Kellis | CSAIL Alliances(在新窗口打開)
  22. Kellis Manolis – Index of Greek Academics in USA(在新窗口打開)