Manolis Kellis
Manolis Kellis是希臘出生的美國計算生物學家,MIT計算機科學教授、Broad Institute成員和MIT計算生物學組負責人,以比較基因組學、表觀基因組路線圖和人類疾病調控迴路研究著稱。
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詞條資料
1977年3月生於雅典
Kellis生於1977年3月。[1]
他自述生於希臘雅典,是John與Anna Kamvysselis最小的孩子,上有姐姐Maria和哥哥Panayiotis。[2]
1980年代末隨家人移居法國
12歲時父親為讓子女學會雙語,舉家遷往法國Aix-en-Provence;約四年後全家移居紐約,他在Lycée Français de New York取得Baccalauréat文憑。[2]
1993年獲法國南部數學競賽一等獎
1993年,他在法國全國性數學競賽中獲南法賽區一等獎。[1]
1999年獲MIT學士和工程碩士學位
他與哥哥、姐姐同年被MIT錄取。[2]
轉向計算生物學之前,他曾在MIT和Xerox PARC從事人工智能、草圖與圖像識別、機器人和計算幾何研究。[3]
他於1999年獲MIT學士和工程碩士學位。研究生一年級時,他看到朋友展示的人類基因組序列數據,隨即決定用計算方法解讀基因組。[4]
2003年5月15日在Nature發表酵母比較基因組論文
2003年5月15日,他作為第一作者在Nature第423捲髮表“Sequencing and comparison of yeast species to identify genes and regulatory elements”(通過測序與比較酵母物種識別基因和調控元件)。[5]
2003年獲MIT博士學位
2003年,他以論文Computational Comparative Genomics: Genes, Regulation, Evolution獲MIT博士學位;2003年6月至2004年6月在Broad Institute做博士後。他獲MIT計算機科學最佳博士論文Sprowls獎。[1]
2004年9月加入MIT教員隊伍
2004年,他成為MIT電氣工程與計算機科學系教員、計算機科學與人工智能實驗室(CSAIL)和Broad Institute成員,2011年獲終身教職,並領導MIT計算生物學組。[4]
2006年9月入選Technology Review TR35
2006年9月,29歲的他入選Technology Review評選的35歲以下創新者(TR35),獲選理由是開發分析多物種完整基因組的算法;當時他已把在酵母上驗證的方法用於比較人與小鼠、大鼠和狗的基因組。[6]
2006年任Class of 1964傑出校友職業發展講席
當時他是MIT電氣工程與計算機科學系助理教授,並擔任Class of 1964傑出校友職業發展講席。[7]
2010年11月獲總統早期職業科學家與工程師獎
2010年11月,MIT宣佈他由美國國立衛生研究院(NIH)提名,獲美國總統早期職業科學家與工程師獎(PECASE)。[8]
2011年10月12日參與29種哺乳動物比較基因組研究
2011年10月,Broad Institute牽頭、他參與的國際團隊在Nature發表29種哺乳動物基因組比較研究,繪製出超過350萬個約佔人類基因組4%的受約束元件,並鑑定出3788個候選新外顯子。[9]
2015年2月18日主導人類表觀基因組參考圖譜分析
2015年2月18日,他領導的團隊代表Roadmap Epigenomics項目在Nature發表111個人類參考表觀基因組,用機器學習劃分出15種染色質狀態,並把約200萬個預測調控區歸為200個協同作用模塊。[10]
2015年8月19日揭示FTO肥胖關聯的代謝開關
2015年8月19日,他作為通訊作者與第一作者Melina Claussnitzer在New England Journal of Medicine發表研究,發現與肥胖關聯最強的FTO區域主要在脂肪前體細胞中通過IRX3和IRX5調控脂肪儲存與產熱;以CRISPR/Cas9編輯單個鹼基即可在人類前脂肪細胞中切換胖與瘦的特徵。[11]
2018年9月在ECCB 2018作主題報告
2018年9月8日至12日在雅典舉行的第17屆歐洲計算生物學會議(ECCB 2018)將他列為主題報告人。[12]
2019年5月1日發表阿爾茨海默病單細胞圖譜
2019年5月1日,他與MIT Picower研究所所長Li-Huei Tsai作為共同通訊作者在Nature發表首個阿爾茨海默病患者單個腦細胞基因表達的全面分析,發現軸突髓鞘化顯著受損,且男女腦細胞對疾病的基因反應差異明顯。[13]
2020年7月31日首次做客Lex Fridman Podcast
2020年7月31日,他首次做客Lex FridmanLex FridmanLex Fridman 是生於蘇聯、在美國長大的計算機科學家和播客主持人,任 MIT 研究科學家,研究人機交互與自動駕駛。他主持的 Lex Fridman Podcast 以數小時長篇對話著稱,嘉賓包括多國領導人和科技企業領袖。點擊查看完整詞條 Podcast(第113期),話題包括人類基因組、自由意志、全基因組進化特徵、COVID-19的進化、病毒與免疫系統以及深度學習。[14]
2020年9月12日第二次做客Lex Fridman Podcast
2020年9月12日,他第二次做客該節目(第123期),談表觀基因組、尼安德特人、地球生命起源、人類思想的演變,並朗誦了兩首詩。[15]
2020年10月25日第三次做客Lex Fridman Podcast
2020年10月25日,他第三次做客該節目(第133期),主題為人類疾病的生物學,涉及疾病的遺傳成分、基因組迴路、CRISPR和線粒體。[16]
2020年11月30日第四次做客Lex Fridman Podcast
2020年11月30日,他第四次做客該節目(第142期),談音樂與人生、人生意義、人類文明、神經網絡與智能以及作為生物體的思想,節目還列出他提到的希臘歌曲。[17]
2021年5月11日完成SARS-CoV-2基因註釋
2021年5月11日,他作為通訊作者與Irwin Jungreis、Rachel Sealfon在Nature Communications發表研究,比較44個沙貝病毒基因組,給出SARS-CoV-2迄今最完整的蛋白編碼基因註釋,並發現核衣殼蛋白某區域的突變明顯多於歷史預期。[18]
2023年4月21日第五次做客Lex Fridman Podcast
2023年4月21日,他第五次做客該節目(第373期),主題為人類文明的演化與超級人工智能,涉及AI對齊、AI對就業市場的影響、人與AI的關係、AI權利與監管以及是否應暫停AI開發。[19]
2025年10月14日在AIxMHC 2025線上演講
2025年10月14日,他在臺灣亞洲大學主辦的2025人工智能×醫療健康照護國際會議(AIxMHC 2025)上以線上方式演講,題為“Applications of Artificial Intelligence in Genomic Medicine”(人工智能在基因組醫學中的應用)。[20]
截至2026年10月:MIT計算生物學組負責人
他是MIT計算機科學教授、CSAIL和Broad Institute成員,領導MIT計算生物學組,研究涵蓋計算生物學、基因組學、AI驅動的藥物發現以及知識探索平臺Mantis,已發表逾325篇期刊論文。他認為通用人工智能已經實現,並主張不宜對AI技術設置過多限制。[21]
他曾領導或參與ENCODE、GTEx等大型基因組計劃,獲獎包括Mendel Medal、NIH院長變革性研究獎和AIT Niki獎。[22]
關聯機構、網站與公開賬號
個人網站:公開鏈接:https://web.mit.edu/manoli/(在新窗口打開)[16]
YouTubeYouTubeYouTube是Google旗下的視頻分享與創作者平臺,2005年由Steve Chen、Chad Hurley和Jawed Karim創辦,2006年被Google收購。平臺圍繞視頻上傳、觀看與創作者收益,發展出Shorts、YouTube Music、Premium、YouTube TV及兒童產品,總部位於美國加利福尼亞州San Bruno。點擊查看完整詞條:公開頻道:https://www.youtube.com/@ManolisKellis1(在新窗口打開)[19]
Massachusetts Institute of Technology:官網:https://www.mit.edu/(在新窗口打開)[7]
Broad Institute of MIT and HarvardHarvard UniversityHarvard University(哈佛大學)是位於美國馬薩諸塞州的私立研究型大學,1636年由馬薩諸塞灣殖民地議會批准設立,1639年以早期捐助人 John Harvard 命名。學校以劍橋、波士頓 Allston 和 Longwood 為主要校區,設 Harvard College、本科以外的專業與研究生學院及 Radcliffe 高等研究院。學校由 Harvard Corporation 與 Board of Overseers 兩個治理機構共同履職;截至2026年10月,校長為 Alan M. Garber。2025財年末捐贈基金規模為569億美元。點擊查看完整詞條:官網:https://www.broadinstitute.org/(在新窗口打開)[22]
來源
- Professional Statement of Manolis Kellis(在新窗口打開)
- Manolis Kamvysselis: Me Myself and I(在新窗口打開)
- Manolis Kellis - Biosketch(在新窗口打開)
- Getting to the root of genetics | MIT News | Massachusetts Institute of Technology(在新窗口打開)
- Sequencing and comparison of yeast species to identify genes and regulatory elements - PubMed(在新窗口打開)
- Manolis Kellis | MIT Technology Review(在新窗口打開)
- MIT faculty, alumni cited as top young innovators in Technology Review | MIT News | Massachusetts Institute of Technology(在新窗口打開)
- 7 win presidential early career honors | MIT News | Massachusetts Institute of Technology(在新窗口打開)
- Understanding the constraints of evolution provides roadmap to mammalian biology | ScienceDaily(在新窗口打開)
- Researchers generate a reference map of the human epigenome | MIT News | Massachusetts Institute of Technology(在新窗口打開)
- A metabolic master switch underlying human obesity | MIT News | Massachusetts Institute of Technology(在新窗口打開)
- Keynote Speakers - ECCB 2018(在新窗口打開)
- A comprehensive map of how Alzheimer's affects the brain | ScienceDaily(在新窗口打開)
- #113 - Manolis Kellis: Human Genome and Evolutionary Dynamics | Lex Fridman Podcast(在新窗口打開)
- #123 - Manolis Kellis: Origin of Life, Humans, Ideas, Suffering, and Happiness | Lex Fridman Podcast(在新窗口打開)
- #133 - Manolis Kellis: Biology of Disease | Lex Fridman Podcast(在新窗口打開)
- #142 - Manolis Kellis: Meaning of Life, the Universe, and Everything | Lex Fridman Podcast(在新窗口打開)
- A comprehensive map of the SARS-CoV-2 genome | ScienceDaily(在新窗口打開)
- #373 – Manolis Kellis: Evolution of Human Civilization and Superintelligent AI | Lex Fridman Podcast(在新窗口打開)
- Day 2 of Asia University’s “AIxMHC” International Conference | Ph.D. Program in Artificial Intelligence(在新窗口打開)
- The Revolutionary Potential of AI with CSAIL Professor Manolis Kellis | CSAIL Alliances(在新窗口打開)
- Kellis Manolis – Index of Greek Academics in USA(在新窗口打開)