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Manolis Kellis

Manolis Kellis是希腊出生的美国计算生物学家,MIT计算机科学教授、Broad Institute成员和MIT计算生物学组负责人,以比较基因组学、表观基因组路线图和人类疾病调控回路研究著称。

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词条资料

生于雅典

Kellis生于1977年3月。⁠[1]

他自述生于希腊雅典,是John与Anna Kamvysselis最小的孩子,上有姐姐Maria和哥哥Panayiotis。⁠[2]

随家人移居法国

12岁时父亲为让子女学会双语,举家迁往法国Aix-en-Provence;约四年后全家移居纽约,他在Lycée Français de New York取得Baccalauréat文凭。⁠[2]

获法国南部数学竞赛一等奖

1993年,他在法国全国性数学竞赛中获南法赛区一等奖。⁠[1]

获MIT学士和工程硕士学位

他与哥哥、姐姐同年被MIT录取。⁠[2]

转向计算生物学之前,他曾在MIT和Xerox PARC从事人工智能、草图与图像识别、机器人和计算几何研究。⁠[3]

他于1999年获MIT学士和工程硕士学位。研究生一年级时,他看到朋友展示的人类基因组序列数据,随即决定用计算方法解读基因组。⁠[4]

在Nature发表酵母比较基因组论文

2003年5月15日,他作为第一作者在Nature第423卷发表“Sequencing and comparison of yeast species to identify genes and regulatory elements”(通过测序与比较酵母物种识别基因和调控元件)。⁠[5]

获MIT博士学位

2003年,他以论文Computational Comparative Genomics: Genes, Regulation, Evolution获MIT博士学位;2003年6月至2004年6月在Broad Institute做博士后。他获MIT计算机科学最佳博士论文Sprowls奖。⁠[1]

加入MIT教员队伍

2004年,他成为MIT电气工程与计算机科学系教员、计算机科学与人工智能实验室(CSAIL)和Broad Institute成员,2011年获终身教职,并领导MIT计算生物学组。⁠[4]

入选Technology Review TR35

2006年9月,29岁的他入选Technology Review评选的35岁以下创新者(TR35),获选理由是开发分析多物种完整基因组的算法;当时他已把在酵母上验证的方法用于比较人与小鼠、大鼠和狗的基因组。⁠[6]

任Class of 1964杰出校友职业发展讲席

当时他是MIT电气工程与计算机科学系助理教授,并担任Class of 1964杰出校友职业发展讲席。⁠[7]

获总统早期职业科学家与工程师奖

2010年11月,MIT宣布他由美国国立卫生研究院(NIH)提名,获美国总统早期职业科学家与工程师奖(PECASE)。⁠[8]

参与29种哺乳动物比较基因组研究

2011年10月,Broad Institute牵头、他参与的国际团队在Nature发表29种哺乳动物基因组比较研究,绘制出超过350万个约占人类基因组4%的受约束元件,并鉴定出3788个候选新外显子。⁠[9]

主导人类表观基因组参考图谱分析

2015年2月18日,他领导的团队代表Roadmap Epigenomics项目在Nature发表111个人类参考表观基因组,用机器学习划分出15种染色质状态,并把约200万个预测调控区归为200个协同作用模块。⁠[10]

揭示FTO肥胖关联的代谢开关

2015年8月19日,他作为通讯作者与第一作者Melina Claussnitzer在New England Journal of Medicine发表研究,发现与肥胖关联最强的FTO区域主要在脂肪前体细胞中通过IRX3和IRX5调控脂肪储存与产热;以CRISPR/Cas9编辑单个碱基即可在人类前脂肪细胞中切换胖与瘦的特征。⁠[11]

在ECCB 2018作主题报告

2018年9月8日至12日在雅典举行的第17届欧洲计算生物学会议(ECCB 2018)将他列为主题报告人。⁠[12]

发表阿尔茨海默病单细胞图谱

2019年5月1日,他与MIT Picower研究所所长Li-Huei Tsai作为共同通讯作者在Nature发表首个阿尔茨海默病患者单个脑细胞基因表达的全面分析,发现轴突髓鞘化显著受损,且男女脑细胞对疾病的基因反应差异明显。⁠[13]

首次做客Lex Fridman Podcast

第二次做客Lex Fridman Podcast

2020年9月12日,他第二次做客该节目(第123期),谈表观基因组、尼安德特人、地球生命起源、人类思想的演变,并朗诵了两首诗。⁠[15]

第三次做客Lex Fridman Podcast

2020年10月25日,他第三次做客该节目(第133期),主题为人类疾病的生物学,涉及疾病的遗传成分、基因组回路、CRISPR和线粒体。⁠[16]

第四次做客Lex Fridman Podcast

2020年11月30日,他第四次做客该节目(第142期),谈音乐与人生、人生意义、人类文明、神经网络与智能以及作为生物体的思想,节目还列出他提到的希腊歌曲。⁠[17]

完成SARS-CoV-2基因注释

2021年5月11日,他作为通讯作者与Irwin Jungreis、Rachel Sealfon在Nature Communications发表研究,比较44个沙贝病毒基因组,给出SARS-CoV-2迄今最完整的蛋白编码基因注释,并发现核衣壳蛋白某区域的突变明显多于历史预期。⁠[18]

第五次做客Lex Fridman Podcast

2023年4月21日,他第五次做客该节目(第373期),主题为人类文明的演化与超级人工智能,涉及AI对齐、AI对就业市场的影响、人与AI的关系、AI权利与监管以及是否应暂停AI开发。⁠[19]

在AIxMHC 2025线上演讲

2025年10月14日,他在台湾亚洲大学主办的2025人工智能×医疗健康照护国际会议(AIxMHC 2025)上以线上方式演讲,题为“Applications of Artificial Intelligence in Genomic Medicine”(人工智能在基因组医学中的应用)。⁠[20]

截至2026年10月:MIT计算生物学组负责人

他是MIT计算机科学教授、CSAIL和Broad Institute成员,领导MIT计算生物学组,研究涵盖计算生物学、基因组学、AI驱动的药物发现以及知识探索平台Mantis,已发表逾325篇期刊论文。他认为通用人工智能已经实现,并主张不宜对AI技术设置过多限制。⁠[21]

他曾领导或参与ENCODE、GTEx等大型基因组计划,获奖包括Mendel Medal、NIH院长变革性研究奖和AIT Niki奖。⁠[22]

关联机构、网站与公开账号

Massachusetts Institute of Technology:官网:https://www.mit.edu/(在新窗口打开)⁠[7]

来源

  1. Professional Statement of Manolis Kellis(在新窗口打开)
  2. Manolis Kamvysselis: Me Myself and I(在新窗口打开)
  3. Manolis Kellis - Biosketch(在新窗口打开)
  4. Getting to the root of genetics | MIT News | Massachusetts Institute of Technology(在新窗口打开)
  5. Sequencing and comparison of yeast species to identify genes and regulatory elements - PubMed(在新窗口打开)
  6. Manolis Kellis | MIT Technology Review(在新窗口打开)
  7. MIT faculty, alumni cited as top young innovators in Technology Review | MIT News | Massachusetts Institute of Technology(在新窗口打开)
  8. 7 win presidential early career honors | MIT News | Massachusetts Institute of Technology(在新窗口打开)
  9. Understanding the constraints of evolution provides roadmap to mammalian biology | ScienceDaily(在新窗口打开)
  10. Researchers generate a reference map of the human epigenome | MIT News | Massachusetts Institute of Technology(在新窗口打开)
  11. A metabolic master switch underlying human obesity | MIT News | Massachusetts Institute of Technology(在新窗口打开)
  12. Keynote Speakers - ECCB 2018(在新窗口打开)
  13. A comprehensive map of how Alzheimer's affects the brain | ScienceDaily(在新窗口打开)
  14. #113 - Manolis Kellis: Human Genome and Evolutionary Dynamics | Lex Fridman Podcast(在新窗口打开)
  15. #123 - Manolis Kellis: Origin of Life, Humans, Ideas, Suffering, and Happiness | Lex Fridman Podcast(在新窗口打开)
  16. #133 - Manolis Kellis: Biology of Disease | Lex Fridman Podcast(在新窗口打开)
  17. #142 - Manolis Kellis: Meaning of Life, the Universe, and Everything | Lex Fridman Podcast(在新窗口打开)
  18. A comprehensive map of the SARS-CoV-2 genome | ScienceDaily(在新窗口打开)
  19. #373 – Manolis Kellis: Evolution of Human Civilization and Superintelligent AI | Lex Fridman Podcast(在新窗口打开)
  20. Day 2 of Asia University’s “AIxMHC” International Conference | Ph.D. Program in Artificial Intelligence(在新窗口打开)
  21. The Revolutionary Potential of AI with CSAIL Professor Manolis Kellis | CSAIL Alliances(在新窗口打开)
  22. Kellis Manolis – Index of Greek Academics in USA(在新窗口打开)